Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 SF1-211ENST00000448404 2778 ntTSL 1 (best)15.15■□□□□ 0.029e-8■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.169e-8■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.179e-8■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.179e-8■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 SF1-204ENST00000377390 3470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.569e-8■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.962e-6■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.632e-6■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.612e-6■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.452e-6■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 ENTPD6-218ENST00000490187 1918 ntTSL 216.8■□□□□ 0.282e-6■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 ENTPD6-217ENST00000485936 2588 ntTSL 215.59■□□□□ 0.092e-6■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 ENTPD6-204ENST00000376666 2100 ntTSL 515.13■□□□□ 0.012e-6■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.245e-8■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 PRPF8-203ENST00000571958 380 ntTSL 311.15□□□□□ -0.625e-8■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 PRPF8-201ENST00000304992 7295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.775e-8■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 FAAP20-214ENST00000497675 4478 ntTSL 215.53■□□□□ 0.083e-9■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 AGRN-202ENST00000419249 861 ntTSL 320.37■□□□□ 0.851e-6■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.123e-25■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.112e-6■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.122e-6■■■□□ 15.7
PCBP1Q15365 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.541e-36■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.061e-6■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.051e-6■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 MED15-211ENST00000433831 3267 ntTSL 514.02□□□□□ -0.161e-6■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.281e-6■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 MED15-230ENST00000492381 3619 ntTSL 210.55□□□□□ -0.721e-6■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.031e-7■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 NUMB-212ENST00000554546 3607 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.581e-7■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 NUMB-202ENST00000356296 3453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.681e-7■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 NUMB-231ENST00000559312 1439 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.081e-7■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.121e-7■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.141e-7■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 NUMB-205ENST00000544991 2757 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.151e-7■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 NUMB-211ENST00000554521 1406 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.181e-7■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 NUMB-232ENST00000560335 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.211e-7■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 NUMB-217ENST00000555738 1553 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.211e-7■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.251e-7■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.331e-7■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.341e-7■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.361e-7■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 HDGF-204ENST00000465180 2060 ntTSL 1 (best)16.81■□□□□ 0.284e-10■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 HDGF-208ENST00000482651 966 ntTSL 39.69□□□□□ -0.864e-10■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 BAZ2A-202ENST00000546695 722 ntTSL 317.69■□□□□ 0.423e-12■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 BAZ2A-215ENST00000551959 483 ntTSL 417.26■□□□□ 0.353e-12■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 BAZ2A-208ENST00000549506 577 ntTSL 27.12□□□□□ -1.273e-12■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 BAZ2A-212ENST00000550730 515 ntTSL 47.12□□□□□ -1.273e-12■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.252e-6■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SRCIN1-211ENST00000612431 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)25.29■■□□□ 1.641e-9■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SAMD4A-207ENST00000555112 2287 ntTSL 1 (best)21.99■■□□□ 1.111e-9■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.751e-9■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.392e-6■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.342e-6■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.251e-9■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.191e-9■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.161e-9■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.152e-6■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.241e-9■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.341e-9■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.41e-9■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SNHG16-208ENST00000591956 556 ntTSL 212.72□□□□□ -0.372e-6■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SNHG16-204ENST00000586942 568 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.62e-6■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SNHG16-207ENST00000590435 1947 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.722e-6■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SNHG16-201ENST00000448136 3607 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.862e-6■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SNHG16-202ENST00000493536 2424 ntTSL 1 (best)9.47□□□□□ -0.892e-6■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SNHG16-206ENST00000587838 884 ntTSL 35.48□□□□□ -1.532e-6■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.12e-6■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 AGAP3-209ENST00000469901 582 ntTSL 322.09■■□□□ 1.134e-21■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 AGAP3-221ENST00000490097 604 ntTSL 416.61■□□□□ 0.254e-21■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 AGAP3-214ENST00000476375 1019 ntTSL 514.54□□□□□ -0.084e-21■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.583e-7■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.153e-7■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SPIRE2-206ENST00000564878 663 ntTSL 320.02■□□□□ 0.83e-7■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.53e-7■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SLC22A31-205ENST00000603735 791 ntTSL 319.16■□□□□ 0.663e-7■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SLC22A31-204ENST00000568161 651 ntTSL 316.37■□□□□ 0.213e-7■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.089e-9■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 NCOR2-220ENST00000493859 557 ntTSL 313.71□□□□□ -0.212e-10■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 MYH9-211ENST00000495928 329 ntTSL 213.32□□□□□ -0.289e-12■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 GNAS-209ENST00000371081 730 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.285e-32■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 NCOR2-222ENST00000536195 452 ntTSL 312.72□□□□□ -0.373e-7■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.535e-32■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.892e-17■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.822e-17■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SLC3A2-213ENST00000539458 565 ntTSL 519.2■□□□□ 0.662e-17■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.542e-17■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.362e-17■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.332e-17■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.282e-17■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SLC3A2-212ENST00000538682 1368 ntTSL 1 (best)16.67■□□□□ 0.262e-17■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SLC3A2-222ENST00000546253 582 ntTSL 416.67■□□□□ 0.262e-17■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SLC3A2-211ENST00000538084 741 ntTSL 316.47■□□□□ 0.232e-17■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SLC3A2-205ENST00000457660 873 ntTSL 513.3□□□□□ -0.282e-17■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SLC3A2-215ENST00000539891 1300 ntTSL 1 (best)12.04□□□□□ -0.482e-17■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SLC3A2-210ENST00000537839 584 ntTSL 511.37□□□□□ -0.592e-17■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SLC3A2-209ENST00000537508 583 ntTSL 210.52□□□□□ -0.732e-17■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 SLC3A2-218ENST00000541649 515 ntTSL 38.02□□□□□ -1.132e-17■■■□□ 15.6
PCBP1Q15365 CBFA2T3-210ENST00000569464 1327 ntTSL 1 (best)15.32■□□□□ 0.041e-6■■■□□ 15.5
PCBP1Q15365 AES-211ENST00000592330 275 ntTSL 54.71□□□□□ -1.666e-8■■■□□ 15.5
PCBP1Q15365 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.173e-9■■■□□ 15.5
PCBP1Q15365 NKD1-202ENST00000564336 477 ntTSL 325.03■■□□□ 1.62e-6■■■□□ 15.5
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