Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCNIQ14094 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms