Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLF9Q13886 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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