Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-215ENST00000491009 863 ntTSL 215.79■□□□□ 0.123e-38■■■■□ 20.2
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PABPC4Q13310 DERL1-201ENST00000259512 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.423e-8■■■■□ 20.2
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PABPC4Q13310 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.982e-7■■■■□ 20.2
PABPC4Q13310 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.42e-7■■■■□ 20.2
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PABPC4Q13310 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.732e-13■■■■□ 20.2
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PABPC4Q13310 MADD-202ENST00000342922 6005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.431e-6■■■■□ 20.2
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PABPC4Q13310 DOCK8-216ENST00000495184 9277 ntTSL 1 (best)8.47□□□□□ -1.051e-6■■■■□ 20.2
PABPC4Q13310 DOCK8-207ENST00000462618 428 ntTSL 37.45□□□□□ -1.221e-6■■■■□ 20.2
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PABPC4Q13310 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.173e-14■■■■□ 20.2
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PABPC4Q13310 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.322e-6■■■■□ 20.1
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PABPC4Q13310 ZC3H15-201ENST00000337859 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.872e-6■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 MMAB-207ENST00000541763 1252 ntTSL 326.72■■□□□ 1.872e-8■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.52e-8■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 MMAB-205ENST00000537496 1188 ntTSL 222.49■■□□□ 1.192e-8■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 MMAB-209ENST00000544051 1089 ntTSL 321.54■■□□□ 1.042e-8■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.072e-8■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 PRRC2A-209ENST00000482441 719 ntTSL 213.82□□□□□ -0.29e-9■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.461e-14■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 RPL14-207ENST00000465325 788 ntTSL 39.59□□□□□ -0.871e-77■■■■□ 20.1
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PABPC4Q13310 IPO4-203ENST00000558046 3440 ntTSL 213.19□□□□□ -0.33e-19■■■■□ 20.1
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PABPC4Q13310 IPO4-214ENST00000560798 3581 ntTSL 212.79□□□□□ -0.363e-19■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 IPO4-217ENST00000561090 3632 ntTSL 212.47□□□□□ -0.413e-19■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 IPO4-201ENST00000354464 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.523e-19■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 IPO4-209ENST00000559588 3537 ntTSL 1 (best)11.59□□□□□ -0.553e-19■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 CDCA5-205ENST00000524733 835 ntTSL 320.91■□□□□ 0.944e-7■■■■□ 20.1
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-201ENST00000460249 773 ntTSL 312.16□□□□□ -0.465e-38■■■■□ 20.1
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