Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP2P42575 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP2P42575 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CASP2P42575 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP2P42575 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP2P42575 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP2P42575 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP2P42575 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP2P42575 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP2P42575 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP2P42575 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP2P42575 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP2P42575 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP2P42575 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP2P42575 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP2P42575 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP2P42575 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP2P42575 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP2P42575 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP2P42575 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP2P42575 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP2P42575 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP2P42575 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP2P42575 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CASP2P42575 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP2P42575 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP2P42575 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP2P42575 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP2P42575 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP2P42575 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP2P42575 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP2P42575 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP2P42575 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP2P42575 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP2P42575 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP2P42575 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP2P42575 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP2P42575 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP2P42575 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP2P42575 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP2P42575 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP2P42575 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP2P42575 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP2P42575 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP2P42575 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP2P42575 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP2P42575 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP2P42575 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP2P42575 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP2P42575 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CASP2P42575 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP2P42575 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP2P42575 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP2P42575 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP2P42575 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP2P42575 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP2P42575 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP2P42575 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP2P42575 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP2P42575 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP2P42575 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP2P42575 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP2P42575 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP2P42575 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP2P42575 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP2P42575 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP2P42575 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP2P42575 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP2P42575 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CASP2P42575 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP2P42575 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP2P42575 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP2P42575 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP2P42575 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP2P42575 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP2P42575 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP2P42575 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP2P42575 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP2P42575 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP2P42575 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP2P42575 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP2P42575 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP2P42575 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP2P42575 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP2P42575 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP2P42575 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP2P42575 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP2P42575 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP2P42575 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP2P42575 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP2P42575 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP2P42575 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP2P42575 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP2P42575 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASP2P42575 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASP2P42575 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASP2P42575 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASP2P42575 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASP2P42575 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP2P42575 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms