Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RDH8Q9NYR8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms