Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNG6Q9BXT2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNG6Q9BXT2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms