Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC38A2Q96QD8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC38A2Q96QD8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms