Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCAP37840 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNCAP37840 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNCAP37840 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNCAP37840 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNCAP37840 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNCAP37840 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNCAP37840 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCAP37840 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCAP37840 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNCAP37840 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms