Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD4O95243 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD4O95243 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD4O95243 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD4O95243 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD4O95243 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD4O95243 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD4O95243 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD4O95243 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD4O95243 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD4O95243 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD4O95243 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD4O95243 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD4O95243 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD4O95243 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD4O95243 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD4O95243 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD4O95243 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MBD4O95243 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD4O95243 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD4O95243 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD4O95243 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD4O95243 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD4O95243 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD4O95243 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD4O95243 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD4O95243 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD4O95243 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD4O95243 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD4O95243 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD4O95243 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD4O95243 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD4O95243 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD4O95243 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD4O95243 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD4O95243 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD4O95243 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD4O95243 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD4O95243 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD4O95243 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD4O95243 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MBD4O95243 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MBD4O95243 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
MBD4O95243 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD4O95243 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD4O95243 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD4O95243 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD4O95243 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD4O95243 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD4O95243 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD4O95243 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD4O95243 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD4O95243 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD4O95243 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD4O95243 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD4O95243 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD4O95243 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD4O95243 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD4O95243 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD4O95243 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD4O95243 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD4O95243 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD4O95243 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD4O95243 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MBD4O95243 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD4O95243 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD4O95243 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD4O95243 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD4O95243 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD4O95243 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD4O95243 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD4O95243 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD4O95243 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MBD4O95243 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms