Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SHANK2Q9UPX8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SHANK2Q9UPX8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms