Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LRIG3Q6UXM1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LRIG3Q6UXM1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms