Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COLEC12Q5KU26 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COLEC12Q5KU26 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms