Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TOP3AQ13472 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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