Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 SRP72-201ENST00000342756 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.472e-9■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.299e-7■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.259e-7■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 CD68-203ENST00000584180 891 ntTSL 213.82□□□□□ -0.29e-7■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 MAN2A2-221ENST00000560451 5124 ntTSL 1 (best)21.79■■□□□ 1.082e-6■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 MAN2A2-204ENST00000558161 4918 ntTSL 1 (best)13.37□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 MAN2A2-215ENST00000559704 449 ntTSL 35.14□□□□□ -1.592e-6■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.352e-38■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 MYL6-205ENST00000546845 452 ntTSL 311.06□□□□□ -0.642e-14■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.882e-38■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.12e-38■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 01e-8■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 MCM2-209ENST00000491422 2844 ntTSL 515.02■□□□□ -01e-8■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 NENF-204ENST00000479589 845 ntTSL 228.6■■■□□ 2.175e-8■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 NENF-203ENST00000473900 875 ntTSL 225.67■■□□□ 1.75e-8■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.495e-8■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 CD63-216ENST00000555199 230 ntTSL 212.35□□□□□ -0.433e-9■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.593e-6■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.892e-6■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 CD99-211ENST00000623253 573 ntTSL 1 (best)19.95■□□□□ 0.782e-6■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 DCPS-202ENST00000529149 2467 ntTSL 216.56■□□□□ 0.243e-6■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 DCPS-203ENST00000530860 661 ntTSL 315.86■□□□□ 0.133e-6■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 EGLN2-211ENST00000595051 477 ntTSL 510.55□□□□□ -0.722e-6■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 RPS10-NUDT3-201ENST00000605528 595 ntTSL 58.2□□□□□ -1.13e-7■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.422e-8■■■■□ 20.6
PABPC4Q13310 H2AFY-210ENST00000506671 1905 ntTSL 521.41■■□□□ 1.021e-13■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 H2AFY-216ENST00000511494 2521 ntTSL 29.81□□□□□ -0.841e-13■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 AC046185.1-201ENST00000580553 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.283e-7■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 TRMT1-211ENST00000588511 2251 ntTSL 521.66■■□□□ 1.062e-6■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 TRMT1-222ENST00000593157 2127 ntTSL 221.46■■□□□ 1.032e-6■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.532e-6■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.222e-6■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.152e-6■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.022e-6■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 MZT2A-204ENST00000445782 980 ntTSL 232.51■■■□□ 2.799e-8■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.299e-8■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 MZT2A-203ENST00000427024 679 ntTSL 321.05■□□□□ 0.969e-8■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 MZT2A-202ENST00000410036 382 ntTSL 520.61■□□□□ 0.899e-8■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.44e-7■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.95e-54■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 ATP5G3-205ENST00000497075 1313 ntTSL 216.39■□□□□ 0.215e-54■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 ATP5G3-201ENST00000284727 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.645e-54■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 ATP5G3-203ENST00000409194 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.765e-54■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.092e-10■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.252e-7■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 RPL9-210ENST00000511643 618 ntTSL 25.98□□□□□ -1.456e-36■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.272e-21■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 UBE2D2-208ENST00000511725 656 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.452e-21■■■■□ 20.5
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PABPC4Q13310 HMGB3-201ENST00000325307 3560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.587e-7■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.611e-6■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.188e-7■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.118e-7■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.114e-6■■■■□ 20.5
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PABPC4Q13310 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.978e-7■■■■□ 20.5
PABPC4Q13310 ERCC1-207ENST00000588738 586 ntTSL 222.43■■□□□ 1.182e-6■■■■□ 20.5
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PABPC4Q13310 RPS6KB2-203ENST00000524814 550 ntTSL 322.48■■□□□ 1.193e-6■■■■□ 20.4
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PABPC4Q13310 RPS6KB2-202ENST00000420069 461 ntTSL 319■□□□□ 0.633e-6■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 RPS6KB2-204ENST00000524934 466 ntTSL 318.96■□□□□ 0.633e-6■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 PSMB4-202ENST00000466425 665 ntTSL 27.24□□□□□ -1.256e-14■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11e-9■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.191e-9■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.241e-9■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 SEC31A-228ENST00000509142 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.471e-9■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 SEC31A-213ENST00000503937 1564 ntTSL 1 (best)8.31□□□□□ -1.081e-9■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.111e-9■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.461e-9■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.591e-9■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.631e-9■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.741e-9■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 CREB3L2-201ENST00000330387 7412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.643e-7■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 CREB3L2-207ENST00000616381 7133 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.83e-7■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.721e-18■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.681e-18■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.982e-6■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.855e-16■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.565e-16■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 RASSF7-203ENST00000414138 1679 ntTSL 327.19■■□□□ 1.945e-16■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.25e-16■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.115e-16■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.765e-6■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 TRMT61A-201ENST00000299202 2827 ntTSL 1 (best)18.59■□□□□ 0.574e-6■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.561e-6■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.551e-6■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 AIFM1-204ENST00000416073 2248 ntTSL 1 (best)17.19■□□□□ 0.341e-6■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.271e-6■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.125e-16■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.11e-6■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.034e-6■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.125e-16■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 SRC-203ENST00000373567 4321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.255e-16■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 SRC-207ENST00000477066 3300 ntTSL 213.29□□□□□ -0.285e-16■■■■□ 20.4
PABPC4Q13310 SRC-201ENST00000358208 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.385e-16■■■■□ 20.4
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