Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALCOCO2Q13137 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALCOCO2Q13137 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms