Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 FTX-204ENST00000430772 708 ntTSL 57.21□□□□□ -1.261e-6■■■□□ 17.6
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ILF3Q12906 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.424e-7■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.754e-7■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 TSPAN14-206ENST00000372164 5476 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.831e-6■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.421e-6■■■□□ 17.6
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ILF3Q12906 LINC01088-206ENST00000510667 534 ntTSL 36.84□□□□□ -1.312e-7■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.532e-7■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 LINC01088-209ENST00000512130 525 ntTSL 35.18□□□□□ -1.582e-7■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.642e-7■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.672e-7■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 LINC01088-211ENST00000515597 664 ntTSL 1 (best)4.03□□□□□ -1.762e-7■■■□□ 17.6
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ILF3Q12906 LINC01088-204ENST00000507761 842 ntTSL 23.83□□□□□ -1.82e-7■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 ACSL4-206ENST00000502391 802 ntTSL 320.55■□□□□ 0.885e-7■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 ACSL4-211ENST00000508092 637 ntTSL 418.55■□□□□ 0.565e-7■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 ACSL4-208ENST00000504980 573 ntTSL 416.89■□□□□ 0.295e-7■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.255e-7■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.15e-7■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 PSD4-203ENST00000409656 2394 ntTSL 215.64■□□□□ 0.095e-7■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 PSD4-204ENST00000418251 5600 ntTSL 513.81□□□□□ -0.25e-7■■■□□ 17.6
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ILF3Q12906 MECP2-206ENST00000460227 1298 ntTSL 512.64□□□□□ -0.399e-10■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.399e-10■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.435e-7■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.449e-10■■■□□ 17.6
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ILF3Q12906 ACSL4-205ENST00000469857 506 ntTSL 1 (best)10.75□□□□□ -0.695e-7■■■□□ 17.6
ILF3Q12906 PSD4-205ENST00000441564 11234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.765e-7■■■□□ 17.6
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ILF3Q12906 PHACTR4-202ENST00000373839 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.637e-7■■■□□ 17.6
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ILF3Q12906 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.052e-6■■■□□ 17.5
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ILF3Q12906 NR1H4-209ENST00000551379 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.13e-6■■■□□ 17.5
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ILF3Q12906 LDLR-208ENST00000558518 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.778e-8■■■□□ 17.5
ILF3Q12906 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.029e-7■■■□□ 17.5
ILF3Q12906 MICALL2-213ENST00000490608 631 ntTSL 214.77□□□□□ -0.052e-8■■■□□ 17.5
ILF3Q12906 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.131e-6■■■□□ 17.5
ILF3Q12906 NFATC3-213ENST00000563319 4122 ntTSL 1 (best)10.01□□□□□ -0.811e-6■■■□□ 17.5
ILF3Q12906 NFATC3-220ENST00000569766 3555 ntTSL 1 (best)7.58□□□□□ -1.21e-6■■■□□ 17.5
ILF3Q12906 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.231e-6■■■□□ 17.5
ILF3Q12906 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.281e-6■■■□□ 17.5
ILF3Q12906 NFATC3-211ENST00000562926 3748 ntTSL 1 (best)6.25□□□□□ -1.411e-6■■■□□ 17.5
ILF3Q12906 NFATC3-216ENST00000566301 3840 ntTSL 1 (best)6.07□□□□□ -1.441e-6■■■□□ 17.5
ILF3Q12906 NFATC3-212ENST00000563288 3790 ntTSL 1 (best)5.98□□□□□ -1.451e-6■■■□□ 17.5
ILF3Q12906 NFATC3-205ENST00000535127 4194 ntTSL 1 (best)5.9□□□□□ -1.471e-6■■■□□ 17.5
ILF3Q12906 NFATC3-221ENST00000570212 3181 ntTSL 1 (best)5.51□□□□□ -1.531e-6■■■□□ 17.5
ILF3Q12906 NFATC3-218ENST00000567152 3186 ntTSL 1 (best)5.3□□□□□ -1.561e-6■■■□□ 17.5
ILF3Q12906 NFATC3-214ENST00000563796 3753 ntTSL 1 (best)4.08□□□□□ -1.761e-6■■■□□ 17.5
ILF3Q12906 CABIN1-206ENST00000454754 1321 ntTSL 1 (best)19.98■□□□□ 0.792e-6■■■□□ 17.5
ILF3Q12906 CABIN1-205ENST00000445422 1472 ntTSL 219.14■□□□□ 0.652e-6■■■□□ 17.5
ILF3Q12906 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.74□□□□□ -2.136e-69■■■□□ 17.5
ILF3Q12906 PCBP1-AS1-321ENST00000628102 644 ntTSL 59.38□□□□□ -0.913e-6■■■□□ 17.5
ILF3Q12906 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.594e-13■■■□□ 17.5
ILF3Q12906 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.424e-13■■■□□ 17.5
ILF3Q12906 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.284e-13■■■□□ 17.5
ILF3Q12906 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.114e-13■■■□□ 17.5
ILF3Q12906 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.224e-13■■■□□ 17.5
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