RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628102.2

PCBP1-AS1-321, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 644 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 NISCHQ9Y2I1 1504 aa24.39■■□□□ 1.49
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ABCC9O60706 1549 aa22.61■■□□□ 1.21
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.28■■□□□ 1.16
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.65■■□□□ 1.06
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.4■■□□□ 1.02
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 NACADO15069 1562 aa21.12■□□□□ 0.97
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.03■□□□□ 0.96
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.77■□□□□ 0.92
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 MYO15BQ96JP2 1530 aa20.67■□□□□ 0.9
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 DCAF8L2P0C7V8 631 aa20.64■□□□□ 0.89
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa20.51■□□□□ 0.87
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.49■□□□□ 0.87
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.46■□□□□ 0.87
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.37■□□□□ 0.85
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa20.18■□□□□ 0.82
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 SCRIBQ14160 1630 aa20.1■□□□□ 0.81
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CUX2O14529 1486 aa19.82■□□□□ 0.76
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ERCC6Q03468 1493 aa19.59■□□□□ 0.73
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 NCAPD3P42695 1498 aa19.45■□□□□ 0.7
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 HMGXB3Q12766 1538 aa19.3■□□□□ 0.68
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.28■□□□□ 0.68
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 SMARCA2P51531 1590 aa19.27■□□□□ 0.67
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 NESP48681 1621 aa19.25■□□□□ 0.67
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 SMARCA4P51532 1647 aa19.18■□□□□ 0.66
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.17■□□□□ 0.66
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 TRIM41Q8WV44 630 aa19.15■□□□□ 0.66
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.14■□□□□ 0.65
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.04■□□□□ 0.64
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19■□□□□ 0.63
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 WDR62O43379 1518 aa18.89■□□□□ 0.61
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 MRC2Q9UBG0 1479 aa18.87■□□□□ 0.61
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CADPSQ9ULU8 1353 aa18.8■□□□□ 0.6
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 MROH2BQ7Z745 1585 aa18.74■□□□□ 0.59
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 OSCARQ8IYS5 282 aa18.73■□□□□ 0.59
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CEP164Q9UPV0 1460 aa18.68■□□□□ 0.58
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa18.64■□□□□ 0.57
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa18.64■□□□□ 0.57
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.64■□□□□ 0.57
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 FANCD2Q9BXW9 1451 aa18.58■□□□□ 0.57
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 WIZO95785 1651 aa18.54■□□□□ 0.56
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CFTRP13569 1480 aa18.49■□□□□ 0.55
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ARHGEF11O15085 1522 aa18.49■□□□□ 0.55
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 PRDM2Q13029 1718 aa18.48■□□□□ 0.55
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 IFT140Q96RY7 1462 aa18.33■□□□□ 0.53
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CHD1O14646 1710 aa18.29■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CYB5RLQ6IPT4 315 aa18.28■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ARAP1Q96P48 1450 aa18.24■□□□□ 0.51
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 TOPBP1Q92547 1522 aa18.19■□□□□ 0.5
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ABCC8Q09428 1581 aa18.17■□□□□ 0.5
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.12■□□□□ 0.49
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.06■□□□□ 0.48
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.02■□□□□ 0.47
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CCDC88BA6NC98 1476 aa18.01■□□□□ 0.47
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 FBLN2P98095 1184 aa17.99■□□□□ 0.47
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 WDR97A6NE52 1622 aa17.98■□□□□ 0.47
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 SYNJ1O43426 1573 aa17.96■□□□□ 0.47
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa17.88■□□□□ 0.45
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa17.85■□□□□ 0.45
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 SOGA1O94964 1423 aa17.83■□□□□ 0.45
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 GAPVD1Q14C86 1478 aa17.81■□□□□ 0.44
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 SYNJ2O15056 1496 aa17.8■□□□□ 0.44
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 PBRM1Q86U86 1689 aa17.79■□□□□ 0.44
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 GRIN2BQ13224 1484 aa17.78■□□□□ 0.44
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 FGD5Q6ZNL6 1462 aa17.75■□□□□ 0.43
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 KIF13AQ9H1H9 1805 aa17.73■□□□□ 0.43
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CUX1P39880 1505 aa17.66■□□□□ 0.42
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa17.63■□□□□ 0.41
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ERCC6L2Q5T890 1561 aa17.62■□□□□ 0.41
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 SHROOM2Q13796 1616 aa17.59■□□□□ 0.41
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 CEP170Q5SW79 1584 aa17.59■□□□□ 0.41
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa17.56■□□□□ 0.4
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 GRIN2AQ12879 1464 aa17.56■□□□□ 0.4
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 NUP160Q12769 1436 aa17.52■□□□□ 0.4
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ADAMTS12P58397 1594 aa17.51■□□□□ 0.39
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 ABCC10Q5T3U5 1492 aa17.44■□□□□ 0.38
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 KDM6BO15054 1643 aa17.42■□□□□ 0.38
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 MAPKBP1O60336 1514 aa17.42■□□□□ 0.38
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 DIP2BQ9P265 1576 aa17.41■□□□□ 0.38
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 FHAD1B1AJZ9 1412 aa17.38■□□□□ 0.37
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa17.38■□□□□ 0.37
PCBP1-AS1-321ENST00000628102 TSPOAP1O95153 1857 aa17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms