Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELF3P78545 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELF3P78545 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELF3P78545 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELF3P78545 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELF3P78545 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELF3P78545 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELF3P78545 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELF3P78545 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELF3P78545 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELF3P78545 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELF3P78545 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELF3P78545 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELF3P78545 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELF3P78545 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELF3P78545 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELF3P78545 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELF3P78545 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELF3P78545 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELF3P78545 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELF3P78545 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ELF3P78545 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ELF3P78545 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELF3P78545 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELF3P78545 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELF3P78545 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELF3P78545 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELF3P78545 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELF3P78545 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELF3P78545 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELF3P78545 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELF3P78545 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELF3P78545 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELF3P78545 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ELF3P78545 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELF3P78545 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELF3P78545 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELF3P78545 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELF3P78545 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELF3P78545 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELF3P78545 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELF3P78545 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELF3P78545 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELF3P78545 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ELF3P78545 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELF3P78545 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ELF3P78545 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELF3P78545 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELF3P78545 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELF3P78545 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELF3P78545 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELF3P78545 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELF3P78545 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELF3P78545 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELF3P78545 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELF3P78545 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELF3P78545 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELF3P78545 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELF3P78545 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELF3P78545 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELF3P78545 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELF3P78545 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELF3P78545 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELF3P78545 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ELF3P78545 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ELF3P78545 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELF3P78545 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELF3P78545 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELF3P78545 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ELF3P78545 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms