Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 TSPEAR-201ENST00000323084 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 NOL10-201ENST00000345985 3333 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DIS3-205ENST00000545453 3651 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 KLC4-201ENST00000259708 2688 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ABLIM1-201ENST00000277895 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MARS2-201ENST00000282276 3019 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ACOXL-AS1-201ENST00000376593 3026 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 RASAL1-203ENST00000446861 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AKAP10-201ENST00000225737 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 LRP12-202ENST00000424843 4092 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 NAPB-203ENST00000432543 3754 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM181A-AS1-202ENST00000554742 2402 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CD300LG-202ENST00000317310 2758 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC39A6-201ENST00000269187 3543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 XIRP1-202ENST00000396251 6040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TSPAN9-206ENST00000537971 4284 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 DNAJB14-205ENST00000442697 6075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 APBB2-214ENST00000508593 3592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PIGG-201ENST00000310340 3203 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CTPS1-202ENST00000372621 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 IKZF4-202ENST00000431367 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ANKRD34A-201ENST00000606888 3613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ARL13B-201ENST00000303097 3264 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 OTOF-205ENST00000403946 6937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 NCL-201ENST00000322723 4034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CTBP2-201ENST00000309035 3669 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 BACE1-202ENST00000392937 5155 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 NID2-201ENST00000216286 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 RABGEF1-201ENST00000284957 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TMCO1-208ENST00000612311 4468 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ATP8A1-201ENST00000264449 8209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SNX13-202ENST00000409604 4146 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PCDHB7-201ENST00000231137 3765 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SEMA6D-201ENST00000316364 6099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 STAT1-212ENST00000540176 4216 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 ECD-201ENST00000372979 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PAPLN-208ENST00000555445 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC45A2-202ENST00000382102 2723 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms