Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
YTHDF1Q9BYJ9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
YTHDF1Q9BYJ9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms