Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSPP1Q1MSJ5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSPP1Q1MSJ5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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