Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLF9Q13886 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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