Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
OTUD4Q01804 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms