Protein–RNA interactions for Protein: P59046

NLRP12, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP12P59046 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NLRP12P59046 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NLRP12P59046 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NLRP12P59046 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NLRP12P59046 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms