Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNPO3Q9Y5L0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TNPO3Q9Y5L0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNPO3Q9Y5L0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNPO3Q9Y5L0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNPO3Q9Y5L0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNPO3Q9Y5L0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNPO3Q9Y5L0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNPO3Q9Y5L0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TNPO3Q9Y5L0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNPO3Q9Y5L0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNPO3Q9Y5L0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNPO3Q9Y5L0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TNPO3Q9Y5L0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNPO3Q9Y5L0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNPO3Q9Y5L0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNPO3Q9Y5L0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNPO3Q9Y5L0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNPO3Q9Y5L0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNPO3Q9Y5L0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNPO3Q9Y5L0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNPO3Q9Y5L0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNPO3Q9Y5L0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TNPO3Q9Y5L0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNPO3Q9Y5L0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNPO3Q9Y5L0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNPO3Q9Y5L0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNPO3Q9Y5L0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNPO3Q9Y5L0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNPO3Q9Y5L0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNPO3Q9Y5L0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNPO3Q9Y5L0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNPO3Q9Y5L0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO3Q9Y5L0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO3Q9Y5L0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO3Q9Y5L0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO3Q9Y5L0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TNPO3Q9Y5L0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO3Q9Y5L0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO3Q9Y5L0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNPO3Q9Y5L0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO3Q9Y5L0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO3Q9Y5L0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TNPO3Q9Y5L0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms