Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y587

AP4S1, AP-4 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4S1Q9Y587 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AP4S1Q9Y587 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP4S1Q9Y587 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP4S1Q9Y587 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP4S1Q9Y587 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP4S1Q9Y587 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP4S1Q9Y587 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP4S1Q9Y587 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP4S1Q9Y587 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP4S1Q9Y587 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP4S1Q9Y587 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP4S1Q9Y587 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
AP4S1Q9Y587 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP4S1Q9Y587 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP4S1Q9Y587 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP4S1Q9Y587 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP4S1Q9Y587 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP4S1Q9Y587 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AP4S1Q9Y587 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AP4S1Q9Y587 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP4S1Q9Y587 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP4S1Q9Y587 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP4S1Q9Y587 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP4S1Q9Y587 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP4S1Q9Y587 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP4S1Q9Y587 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP4S1Q9Y587 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP4S1Q9Y587 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AP4S1Q9Y587 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP4S1Q9Y587 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP4S1Q9Y587 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP4S1Q9Y587 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP4S1Q9Y587 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP4S1Q9Y587 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP4S1Q9Y587 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP4S1Q9Y587 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP4S1Q9Y587 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP4S1Q9Y587 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP4S1Q9Y587 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP4S1Q9Y587 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP4S1Q9Y587 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP4S1Q9Y587 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP4S1Q9Y587 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP4S1Q9Y587 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP4S1Q9Y587 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP4S1Q9Y587 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP4S1Q9Y587 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
AP4S1Q9Y587 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP4S1Q9Y587 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP4S1Q9Y587 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP4S1Q9Y587 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP4S1Q9Y587 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP4S1Q9Y587 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP4S1Q9Y587 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP4S1Q9Y587 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP4S1Q9Y587 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP4S1Q9Y587 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP4S1Q9Y587 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP4S1Q9Y587 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP4S1Q9Y587 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP4S1Q9Y587 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP4S1Q9Y587 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP4S1Q9Y587 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP4S1Q9Y587 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP4S1Q9Y587 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP4S1Q9Y587 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
AP4S1Q9Y587 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AP4S1Q9Y587 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP4S1Q9Y587 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP4S1Q9Y587 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP4S1Q9Y587 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AP4S1Q9Y587 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 334.8 ms