Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y543

HES2, Transcription factor HES-2, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES2Q9Y543 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HES2Q9Y543 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HES2Q9Y543 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HES2Q9Y543 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HES2Q9Y543 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HES2Q9Y543 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HES2Q9Y543 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HES2Q9Y543 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HES2Q9Y543 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HES2Q9Y543 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HES2Q9Y543 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HES2Q9Y543 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HES2Q9Y543 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HES2Q9Y543 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HES2Q9Y543 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HES2Q9Y543 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HES2Q9Y543 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HES2Q9Y543 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HES2Q9Y543 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HES2Q9Y543 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HES2Q9Y543 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HES2Q9Y543 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HES2Q9Y543 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HES2Q9Y543 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HES2Q9Y543 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HES2Q9Y543 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HES2Q9Y543 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HES2Q9Y543 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HES2Q9Y543 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HES2Q9Y543 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HES2Q9Y543 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HES2Q9Y543 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HES2Q9Y543 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HES2Q9Y543 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HES2Q9Y543 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HES2Q9Y543 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HES2Q9Y543 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HES2Q9Y543 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HES2Q9Y543 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HES2Q9Y543 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HES2Q9Y543 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HES2Q9Y543 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HES2Q9Y543 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
HES2Q9Y543 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms