Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3BP1Q9Y3L3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SH3BP1Q9Y3L3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3BP1Q9Y3L3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3BP1Q9Y3L3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SH3BP1Q9Y3L3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3BP1Q9Y3L3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SH3BP1Q9Y3L3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SH3BP1Q9Y3L3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH3BP1Q9Y3L3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH3BP1Q9Y3L3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SH3BP1Q9Y3L3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH3BP1Q9Y3L3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH3BP1Q9Y3L3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SH3BP1Q9Y3L3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH3BP1Q9Y3L3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH3BP1Q9Y3L3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH3BP1Q9Y3L3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SH3BP1Q9Y3L3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3BP1Q9Y3L3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SH3BP1Q9Y3L3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SH3BP1Q9Y3L3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SH3BP1Q9Y3L3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SH3BP1Q9Y3L3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SH3BP1Q9Y3L3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SH3BP1Q9Y3L3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3BP1Q9Y3L3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SH3BP1Q9Y3L3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3BP1Q9Y3L3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3BP1Q9Y3L3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SH3BP1Q9Y3L3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3BP1Q9Y3L3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3BP1Q9Y3L3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3BP1Q9Y3L3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3BP1Q9Y3L3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3BP1Q9Y3L3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SH3BP1Q9Y3L3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3BP1Q9Y3L3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3BP1Q9Y3L3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3BP1Q9Y3L3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SH3BP1Q9Y3L3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH3BP1Q9Y3L3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH3BP1Q9Y3L3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH3BP1Q9Y3L3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3BP1Q9Y3L3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3BP1Q9Y3L3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3BP1Q9Y3L3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3BP1Q9Y3L3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3BP1Q9Y3L3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3BP1Q9Y3L3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SH3BP1Q9Y3L3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms