Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC4Q9Y296 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC4Q9Y296 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC4Q9Y296 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC4Q9Y296 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC4Q9Y296 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC4Q9Y296 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC4Q9Y296 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC4Q9Y296 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC4Q9Y296 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC4Q9Y296 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC4Q9Y296 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC4Q9Y296 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC4Q9Y296 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC4Q9Y296 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAPPC4Q9Y296 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC4Q9Y296 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC4Q9Y296 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC4Q9Y296 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC4Q9Y296 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC4Q9Y296 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC4Q9Y296 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC4Q9Y296 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC4Q9Y296 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC4Q9Y296 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC4Q9Y296 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC4Q9Y296 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC4Q9Y296 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC4Q9Y296 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC4Q9Y296 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC4Q9Y296 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC4Q9Y296 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC4Q9Y296 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC4Q9Y296 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC4Q9Y296 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC4Q9Y296 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC4Q9Y296 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC4Q9Y296 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC4Q9Y296 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC4Q9Y296 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC4Q9Y296 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC4Q9Y296 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC4Q9Y296 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC4Q9Y296 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC4Q9Y296 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC4Q9Y296 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC4Q9Y296 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC4Q9Y296 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC4Q9Y296 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC4Q9Y296 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC4Q9Y296 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC4Q9Y296 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC4Q9Y296 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC4Q9Y296 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC4Q9Y296 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC4Q9Y296 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC4Q9Y296 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC4Q9Y296 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC4Q9Y296 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC4Q9Y296 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC4Q9Y296 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC4Q9Y296 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC4Q9Y296 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC4Q9Y296 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC4Q9Y296 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC4Q9Y296 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC4Q9Y296 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC4Q9Y296 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC4Q9Y296 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.3 ms