Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DSEQ9UL01 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DSEQ9UL01 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
DSEQ9UL01 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DSEQ9UL01 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DSEQ9UL01 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSEQ9UL01 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSEQ9UL01 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DSEQ9UL01 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DSEQ9UL01 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DSEQ9UL01 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DSEQ9UL01 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DSEQ9UL01 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DSEQ9UL01 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DSEQ9UL01 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSEQ9UL01 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSEQ9UL01 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSEQ9UL01 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSEQ9UL01 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSEQ9UL01 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSEQ9UL01 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSEQ9UL01 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DSEQ9UL01 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DSEQ9UL01 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DSEQ9UL01 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DSEQ9UL01 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DSEQ9UL01 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSEQ9UL01 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DSEQ9UL01 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DSEQ9UL01 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DSEQ9UL01 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSEQ9UL01 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSEQ9UL01 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSEQ9UL01 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DSEQ9UL01 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSEQ9UL01 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSEQ9UL01 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSEQ9UL01 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSEQ9UL01 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSEQ9UL01 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSEQ9UL01 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DSEQ9UL01 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DSEQ9UL01 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DSEQ9UL01 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DSEQ9UL01 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DSEQ9UL01 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DSEQ9UL01 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DSEQ9UL01 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DSEQ9UL01 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DSEQ9UL01 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DSEQ9UL01 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DSEQ9UL01 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DSEQ9UL01 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DSEQ9UL01 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DSEQ9UL01 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DSEQ9UL01 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DSEQ9UL01 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DSEQ9UL01 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSEQ9UL01 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSEQ9UL01 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSEQ9UL01 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSEQ9UL01 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSEQ9UL01 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSEQ9UL01 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSEQ9UL01 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSEQ9UL01 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSEQ9UL01 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSEQ9UL01 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSEQ9UL01 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSEQ9UL01 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSEQ9UL01 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DSEQ9UL01 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DSEQ9UL01 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DSEQ9UL01 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DSEQ9UL01 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DSEQ9UL01 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DSEQ9UL01 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DSEQ9UL01 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DSEQ9UL01 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DSEQ9UL01 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DSEQ9UL01 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DSEQ9UL01 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DSEQ9UL01 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DSEQ9UL01 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DSEQ9UL01 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DSEQ9UL01 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DSEQ9UL01 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DSEQ9UL01 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DSEQ9UL01 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DSEQ9UL01 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DSEQ9UL01 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DSEQ9UL01 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DSEQ9UL01 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DSEQ9UL01 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DSEQ9UL01 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DSEQ9UL01 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DSEQ9UL01 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DSEQ9UL01 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DSEQ9UL01 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DSEQ9UL01 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms