Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CLIP2Q9UDT6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLIP2Q9UDT6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CLIP2Q9UDT6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CLIP2Q9UDT6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CLIP2Q9UDT6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CLIP2Q9UDT6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CLIP2Q9UDT6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLIP2Q9UDT6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLIP2Q9UDT6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLIP2Q9UDT6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CLIP2Q9UDT6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CLIP2Q9UDT6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CLIP2Q9UDT6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CLIP2Q9UDT6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLIP2Q9UDT6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CLIP2Q9UDT6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CLIP2Q9UDT6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CLIP2Q9UDT6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CLIP2Q9UDT6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CLIP2Q9UDT6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CLIP2Q9UDT6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CLIP2Q9UDT6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CLIP2Q9UDT6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CLIP2Q9UDT6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CLIP2Q9UDT6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CLIP2Q9UDT6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CLIP2Q9UDT6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CLIP2Q9UDT6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CLIP2Q9UDT6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CLIP2Q9UDT6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CLIP2Q9UDT6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CLIP2Q9UDT6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CLIP2Q9UDT6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CLIP2Q9UDT6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CLIP2Q9UDT6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CLIP2Q9UDT6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CLIP2Q9UDT6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CLIP2Q9UDT6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CLIP2Q9UDT6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CLIP2Q9UDT6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CLIP2Q9UDT6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CLIP2Q9UDT6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CLIP2Q9UDT6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CLIP2Q9UDT6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CLIP2Q9UDT6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CLIP2Q9UDT6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CLIP2Q9UDT6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CLIP2Q9UDT6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CLIP2Q9UDT6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CLIP2Q9UDT6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CLIP2Q9UDT6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLIP2Q9UDT6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLIP2Q9UDT6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLIP2Q9UDT6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLIP2Q9UDT6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLIP2Q9UDT6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CLIP2Q9UDT6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CLIP2Q9UDT6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLIP2Q9UDT6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLIP2Q9UDT6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLIP2Q9UDT6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CLIP2Q9UDT6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLIP2Q9UDT6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLIP2Q9UDT6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLIP2Q9UDT6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLIP2Q9UDT6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CLIP2Q9UDT6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CLIP2Q9UDT6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CLIP2Q9UDT6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CLIP2Q9UDT6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CLIP2Q9UDT6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CLIP2Q9UDT6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CLIP2Q9UDT6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CLIP2Q9UDT6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CLIP2Q9UDT6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CLIP2Q9UDT6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CLIP2Q9UDT6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CLIP2Q9UDT6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
CLIP2Q9UDT6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLIP2Q9UDT6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLIP2Q9UDT6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLIP2Q9UDT6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLIP2Q9UDT6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CLIP2Q9UDT6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLIP2Q9UDT6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLIP2Q9UDT6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CLIP2Q9UDT6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLIP2Q9UDT6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLIP2Q9UDT6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLIP2Q9UDT6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLIP2Q9UDT6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLIP2Q9UDT6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLIP2Q9UDT6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLIP2Q9UDT6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLIP2Q9UDT6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CLIP2Q9UDT6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP2Q9UDT6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms