Protein–RNA interactions for Protein: Q9P283

SEMA5B, Semaphorin-5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5BQ9P283 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA5BQ9P283 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA5BQ9P283 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA5BQ9P283 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA5BQ9P283 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA5BQ9P283 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA5BQ9P283 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA5BQ9P283 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA5BQ9P283 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA5BQ9P283 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA5BQ9P283 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA5BQ9P283 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA5BQ9P283 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA5BQ9P283 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA5BQ9P283 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA5BQ9P283 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA5BQ9P283 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA5BQ9P283 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA5BQ9P283 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA5BQ9P283 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA5BQ9P283 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA5BQ9P283 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA5BQ9P283 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA5BQ9P283 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA5BQ9P283 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA5BQ9P283 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA5BQ9P283 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA5BQ9P283 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA5BQ9P283 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA5BQ9P283 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA5BQ9P283 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA5BQ9P283 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA5BQ9P283 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA5BQ9P283 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA5BQ9P283 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA5BQ9P283 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA5BQ9P283 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA5BQ9P283 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA5BQ9P283 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA5BQ9P283 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA5BQ9P283 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA5BQ9P283 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA5BQ9P283 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA5BQ9P283 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA5BQ9P283 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA5BQ9P283 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA5BQ9P283 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA5BQ9P283 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA5BQ9P283 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA5BQ9P283 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA5BQ9P283 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA5BQ9P283 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA5BQ9P283 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA5BQ9P283 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA5BQ9P283 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA5BQ9P283 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA5BQ9P283 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA5BQ9P283 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA5BQ9P283 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA5BQ9P283 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA5BQ9P283 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA5BQ9P283 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA5BQ9P283 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA5BQ9P283 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA5BQ9P283 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA5BQ9P283 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA5BQ9P283 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA5BQ9P283 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA5BQ9P283 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA5BQ9P283 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms