Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRFN1Q9P244 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRFN1Q9P244 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRFN1Q9P244 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRFN1Q9P244 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LRFN1Q9P244 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRFN1Q9P244 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRFN1Q9P244 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRFN1Q9P244 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN1Q9P244 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRFN1Q9P244 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN1Q9P244 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN1Q9P244 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN1Q9P244 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN1Q9P244 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN1Q9P244 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN1Q9P244 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN1Q9P244 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN1Q9P244 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRFN1Q9P244 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN1Q9P244 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN1Q9P244 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN1Q9P244 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN1Q9P244 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN1Q9P244 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRFN1Q9P244 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN1Q9P244 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRFN1Q9P244 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN1Q9P244 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN1Q9P244 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN1Q9P244 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN1Q9P244 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN1Q9P244 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRFN1Q9P244 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRFN1Q9P244 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN1Q9P244 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN1Q9P244 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRFN1Q9P244 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN1Q9P244 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN1Q9P244 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN1Q9P244 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRFN1Q9P244 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN1Q9P244 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRFN1Q9P244 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN1Q9P244 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRFN1Q9P244 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN1Q9P244 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN1Q9P244 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN1Q9P244 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN1Q9P244 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN1Q9P244 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN1Q9P244 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRFN1Q9P244 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN1Q9P244 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN1Q9P244 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN1Q9P244 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRFN1Q9P244 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms