Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
HMG20BQ9P0W2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
HMG20BQ9P0W2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
HMG20BQ9P0W2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HMG20BQ9P0W2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HMG20BQ9P0W2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
HMG20BQ9P0W2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HMG20BQ9P0W2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
HMG20BQ9P0W2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
HMG20BQ9P0W2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
HMG20BQ9P0W2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HMG20BQ9P0W2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
HMG20BQ9P0W2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HMG20BQ9P0W2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
HMG20BQ9P0W2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
HMG20BQ9P0W2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HMG20BQ9P0W2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
HMG20BQ9P0W2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
HMG20BQ9P0W2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
HMG20BQ9P0W2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
HMG20BQ9P0W2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HMG20BQ9P0W2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HMG20BQ9P0W2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
HMG20BQ9P0W2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HMG20BQ9P0W2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HMG20BQ9P0W2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
HMG20BQ9P0W2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
HMG20BQ9P0W2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
HMG20BQ9P0W2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
HMG20BQ9P0W2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
HMG20BQ9P0W2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HMG20BQ9P0W2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
HMG20BQ9P0W2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
HMG20BQ9P0W2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HMG20BQ9P0W2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HMG20BQ9P0W2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HMG20BQ9P0W2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HMG20BQ9P0W2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HMG20BQ9P0W2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HMG20BQ9P0W2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HMG20BQ9P0W2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HMG20BQ9P0W2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HMG20BQ9P0W2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HMG20BQ9P0W2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HMG20BQ9P0W2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HMG20BQ9P0W2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HMG20BQ9P0W2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HMG20BQ9P0W2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
HMG20BQ9P0W2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
HMG20BQ9P0W2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
HMG20BQ9P0W2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
HMG20BQ9P0W2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
HMG20BQ9P0W2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
HMG20BQ9P0W2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
HMG20BQ9P0W2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
HMG20BQ9P0W2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
HMG20BQ9P0W2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
HMG20BQ9P0W2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
HMG20BQ9P0W2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
HMG20BQ9P0W2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HMG20BQ9P0W2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
HMG20BQ9P0W2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HMG20BQ9P0W2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HMG20BQ9P0W2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
HMG20BQ9P0W2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
HMG20BQ9P0W2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HMG20BQ9P0W2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HMG20BQ9P0W2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
HMG20BQ9P0W2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
HMG20BQ9P0W2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
HMG20BQ9P0W2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HMG20BQ9P0W2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
HMG20BQ9P0W2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
HMG20BQ9P0W2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HMG20BQ9P0W2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
HMG20BQ9P0W2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
HMG20BQ9P0W2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
HMG20BQ9P0W2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HMG20BQ9P0W2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HMG20BQ9P0W2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
HMG20BQ9P0W2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
HMG20BQ9P0W2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
HMG20BQ9P0W2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
HMG20BQ9P0W2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
HMG20BQ9P0W2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
HMG20BQ9P0W2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
HMG20BQ9P0W2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HMG20BQ9P0W2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
HMG20BQ9P0W2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
HMG20BQ9P0W2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
HMG20BQ9P0W2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
HMG20BQ9P0W2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
HMG20BQ9P0W2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
HMG20BQ9P0W2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
HMG20BQ9P0W2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HMG20BQ9P0W2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HMG20BQ9P0W2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
HMG20BQ9P0W2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
HMG20BQ9P0W2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
HMG20BQ9P0W2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms