Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EHD3Q9NZN3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EHD3Q9NZN3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD3Q9NZN3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD3Q9NZN3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EHD3Q9NZN3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD3Q9NZN3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD3Q9NZN3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD3Q9NZN3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD3Q9NZN3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD3Q9NZN3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD3Q9NZN3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EHD3Q9NZN3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD3Q9NZN3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD3Q9NZN3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD3Q9NZN3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD3Q9NZN3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD3Q9NZN3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EHD3Q9NZN3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
EHD3Q9NZN3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
EHD3Q9NZN3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EHD3Q9NZN3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD3Q9NZN3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD3Q9NZN3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD3Q9NZN3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD3Q9NZN3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EHD3Q9NZN3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EHD3Q9NZN3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EHD3Q9NZN3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EHD3Q9NZN3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EHD3Q9NZN3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EHD3Q9NZN3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EHD3Q9NZN3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EHD3Q9NZN3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EHD3Q9NZN3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EHD3Q9NZN3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EHD3Q9NZN3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EHD3Q9NZN3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms