Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNIP1Q9NZI2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNIP1Q9NZI2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNIP1Q9NZI2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNIP1Q9NZI2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNIP1Q9NZI2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNIP1Q9NZI2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNIP1Q9NZI2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNIP1Q9NZI2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNIP1Q9NZI2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNIP1Q9NZI2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNIP1Q9NZI2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNIP1Q9NZI2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNIP1Q9NZI2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms