Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ43

USE1, Vesicle transport protein USE1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USE1Q9NZ43 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
USE1Q9NZ43 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USE1Q9NZ43 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
USE1Q9NZ43 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USE1Q9NZ43 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
USE1Q9NZ43 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USE1Q9NZ43 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USE1Q9NZ43 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
USE1Q9NZ43 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
USE1Q9NZ43 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USE1Q9NZ43 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USE1Q9NZ43 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USE1Q9NZ43 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USE1Q9NZ43 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USE1Q9NZ43 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USE1Q9NZ43 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USE1Q9NZ43 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USE1Q9NZ43 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USE1Q9NZ43 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USE1Q9NZ43 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USE1Q9NZ43 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USE1Q9NZ43 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USE1Q9NZ43 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USE1Q9NZ43 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USE1Q9NZ43 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USE1Q9NZ43 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USE1Q9NZ43 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USE1Q9NZ43 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USE1Q9NZ43 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USE1Q9NZ43 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USE1Q9NZ43 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USE1Q9NZ43 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USE1Q9NZ43 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USE1Q9NZ43 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USE1Q9NZ43 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USE1Q9NZ43 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USE1Q9NZ43 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USE1Q9NZ43 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USE1Q9NZ43 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USE1Q9NZ43 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USE1Q9NZ43 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USE1Q9NZ43 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USE1Q9NZ43 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USE1Q9NZ43 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USE1Q9NZ43 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USE1Q9NZ43 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USE1Q9NZ43 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USE1Q9NZ43 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USE1Q9NZ43 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USE1Q9NZ43 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USE1Q9NZ43 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USE1Q9NZ43 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USE1Q9NZ43 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USE1Q9NZ43 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USE1Q9NZ43 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USE1Q9NZ43 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USE1Q9NZ43 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USE1Q9NZ43 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USE1Q9NZ43 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USE1Q9NZ43 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USE1Q9NZ43 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USE1Q9NZ43 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USE1Q9NZ43 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USE1Q9NZ43 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USE1Q9NZ43 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USE1Q9NZ43 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USE1Q9NZ43 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USE1Q9NZ43 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USE1Q9NZ43 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USE1Q9NZ43 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USE1Q9NZ43 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USE1Q9NZ43 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USE1Q9NZ43 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USE1Q9NZ43 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USE1Q9NZ43 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USE1Q9NZ43 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USE1Q9NZ43 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USE1Q9NZ43 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USE1Q9NZ43 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USE1Q9NZ43 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USE1Q9NZ43 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USE1Q9NZ43 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USE1Q9NZ43 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USE1Q9NZ43 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USE1Q9NZ43 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USE1Q9NZ43 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USE1Q9NZ43 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USE1Q9NZ43 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USE1Q9NZ43 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USE1Q9NZ43 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USE1Q9NZ43 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USE1Q9NZ43 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USE1Q9NZ43 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USE1Q9NZ43 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
USE1Q9NZ43 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
USE1Q9NZ43 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USE1Q9NZ43 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USE1Q9NZ43 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USE1Q9NZ43 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USE1Q9NZ43 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms