Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
MIS18AQ9NYP9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
MIS18AQ9NYP9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MIS18AQ9NYP9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
MIS18AQ9NYP9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
MIS18AQ9NYP9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
MIS18AQ9NYP9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
MIS18AQ9NYP9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
MIS18AQ9NYP9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
MIS18AQ9NYP9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
MIS18AQ9NYP9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
MIS18AQ9NYP9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
MIS18AQ9NYP9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
MIS18AQ9NYP9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
MIS18AQ9NYP9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
MIS18AQ9NYP9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
MIS18AQ9NYP9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
MIS18AQ9NYP9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
MIS18AQ9NYP9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
MIS18AQ9NYP9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
MIS18AQ9NYP9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
MIS18AQ9NYP9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
MIS18AQ9NYP9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
MIS18AQ9NYP9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
MIS18AQ9NYP9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
MIS18AQ9NYP9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
MIS18AQ9NYP9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
MIS18AQ9NYP9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
MIS18AQ9NYP9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
MIS18AQ9NYP9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
MIS18AQ9NYP9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
MIS18AQ9NYP9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
MIS18AQ9NYP9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
MIS18AQ9NYP9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
MIS18AQ9NYP9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
MIS18AQ9NYP9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
MIS18AQ9NYP9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
MIS18AQ9NYP9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
MIS18AQ9NYP9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
MIS18AQ9NYP9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
MIS18AQ9NYP9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
MIS18AQ9NYP9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
MIS18AQ9NYP9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
MIS18AQ9NYP9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
MIS18AQ9NYP9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
MIS18AQ9NYP9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
MIS18AQ9NYP9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
MIS18AQ9NYP9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
MIS18AQ9NYP9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
MIS18AQ9NYP9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
MIS18AQ9NYP9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
MIS18AQ9NYP9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
MIS18AQ9NYP9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
MIS18AQ9NYP9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
MIS18AQ9NYP9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
MIS18AQ9NYP9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
MIS18AQ9NYP9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
MIS18AQ9NYP9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MIS18AQ9NYP9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
MIS18AQ9NYP9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
MIS18AQ9NYP9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
MIS18AQ9NYP9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
MIS18AQ9NYP9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
MIS18AQ9NYP9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
MIS18AQ9NYP9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
MIS18AQ9NYP9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
MIS18AQ9NYP9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
MIS18AQ9NYP9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
MIS18AQ9NYP9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms