Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ASF1BQ9NVP2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASF1BQ9NVP2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASF1BQ9NVP2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASF1BQ9NVP2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASF1BQ9NVP2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ASF1BQ9NVP2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASF1BQ9NVP2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASF1BQ9NVP2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASF1BQ9NVP2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ASF1BQ9NVP2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASF1BQ9NVP2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASF1BQ9NVP2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ASF1BQ9NVP2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ASF1BQ9NVP2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASF1BQ9NVP2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASF1BQ9NVP2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASF1BQ9NVP2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ASF1BQ9NVP2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASF1BQ9NVP2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASF1BQ9NVP2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASF1BQ9NVP2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ASF1BQ9NVP2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASF1BQ9NVP2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ASF1BQ9NVP2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASF1BQ9NVP2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ASF1BQ9NVP2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASF1BQ9NVP2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ASF1BQ9NVP2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASF1BQ9NVP2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ASF1BQ9NVP2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASF1BQ9NVP2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ASF1BQ9NVP2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ASF1BQ9NVP2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASF1BQ9NVP2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASF1BQ9NVP2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ASF1BQ9NVP2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASF1BQ9NVP2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ASF1BQ9NVP2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASF1BQ9NVP2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASF1BQ9NVP2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASF1BQ9NVP2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASF1BQ9NVP2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ASF1BQ9NVP2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms