Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INTS9Q9NV88 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
INTS9Q9NV88 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
INTS9Q9NV88 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
INTS9Q9NV88 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
INTS9Q9NV88 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
INTS9Q9NV88 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
INTS9Q9NV88 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
INTS9Q9NV88 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
INTS9Q9NV88 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
INTS9Q9NV88 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
INTS9Q9NV88 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
INTS9Q9NV88 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
INTS9Q9NV88 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
INTS9Q9NV88 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
INTS9Q9NV88 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
INTS9Q9NV88 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
INTS9Q9NV88 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
INTS9Q9NV88 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
INTS9Q9NV88 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
INTS9Q9NV88 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
INTS9Q9NV88 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
INTS9Q9NV88 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
INTS9Q9NV88 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
INTS9Q9NV88 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
INTS9Q9NV88 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
INTS9Q9NV88 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
INTS9Q9NV88 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
INTS9Q9NV88 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
INTS9Q9NV88 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
INTS9Q9NV88 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
INTS9Q9NV88 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
INTS9Q9NV88 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
INTS9Q9NV88 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
INTS9Q9NV88 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
INTS9Q9NV88 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
INTS9Q9NV88 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
INTS9Q9NV88 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
INTS9Q9NV88 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
INTS9Q9NV88 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INTS9Q9NV88 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
INTS9Q9NV88 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
INTS9Q9NV88 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
INTS9Q9NV88 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
INTS9Q9NV88 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
INTS9Q9NV88 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
INTS9Q9NV88 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
INTS9Q9NV88 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
INTS9Q9NV88 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
INTS9Q9NV88 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
INTS9Q9NV88 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
INTS9Q9NV88 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
INTS9Q9NV88 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
INTS9Q9NV88 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
INTS9Q9NV88 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
INTS9Q9NV88 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
INTS9Q9NV88 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
INTS9Q9NV88 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
INTS9Q9NV88 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
INTS9Q9NV88 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
INTS9Q9NV88 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
INTS9Q9NV88 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
INTS9Q9NV88 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
INTS9Q9NV88 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
INTS9Q9NV88 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
INTS9Q9NV88 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
INTS9Q9NV88 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
INTS9Q9NV88 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
INTS9Q9NV88 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
INTS9Q9NV88 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
INTS9Q9NV88 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
INTS9Q9NV88 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
INTS9Q9NV88 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INTS9Q9NV88 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
INTS9Q9NV88 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
INTS9Q9NV88 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INTS9Q9NV88 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
INTS9Q9NV88 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INTS9Q9NV88 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INTS9Q9NV88 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INTS9Q9NV88 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INTS9Q9NV88 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INTS9Q9NV88 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INTS9Q9NV88 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
INTS9Q9NV88 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
INTS9Q9NV88 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
INTS9Q9NV88 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
INTS9Q9NV88 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
INTS9Q9NV88 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
INTS9Q9NV88 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
INTS9Q9NV88 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
INTS9Q9NV88 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
INTS9Q9NV88 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
INTS9Q9NV88 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
INTS9Q9NV88 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
INTS9Q9NV88 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
INTS9Q9NV88 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INTS9Q9NV88 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INTS9Q9NV88 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INTS9Q9NV88 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.7 ms