Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SALL1Q9NSC2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SALL1Q9NSC2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SALL1Q9NSC2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SALL1Q9NSC2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SALL1Q9NSC2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SALL1Q9NSC2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SALL1Q9NSC2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
SALL1Q9NSC2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
SALL1Q9NSC2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SALL1Q9NSC2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SALL1Q9NSC2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SALL1Q9NSC2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SALL1Q9NSC2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SALL1Q9NSC2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SALL1Q9NSC2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SALL1Q9NSC2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SALL1Q9NSC2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SALL1Q9NSC2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SALL1Q9NSC2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SALL1Q9NSC2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SALL1Q9NSC2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SALL1Q9NSC2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SALL1Q9NSC2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
SALL1Q9NSC2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SALL1Q9NSC2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SALL1Q9NSC2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
SALL1Q9NSC2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SALL1Q9NSC2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
SALL1Q9NSC2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SALL1Q9NSC2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SALL1Q9NSC2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SALL1Q9NSC2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SALL1Q9NSC2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SALL1Q9NSC2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SALL1Q9NSC2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SALL1Q9NSC2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SALL1Q9NSC2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SALL1Q9NSC2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SALL1Q9NSC2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SALL1Q9NSC2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SALL1Q9NSC2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SALL1Q9NSC2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SALL1Q9NSC2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SALL1Q9NSC2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SALL1Q9NSC2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SALL1Q9NSC2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms