Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ66

PLCB1, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB1Q9NQ66 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLCB1Q9NQ66 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLCB1Q9NQ66 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLCB1Q9NQ66 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLCB1Q9NQ66 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLCB1Q9NQ66 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLCB1Q9NQ66 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLCB1Q9NQ66 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLCB1Q9NQ66 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLCB1Q9NQ66 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLCB1Q9NQ66 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLCB1Q9NQ66 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLCB1Q9NQ66 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLCB1Q9NQ66 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLCB1Q9NQ66 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLCB1Q9NQ66 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLCB1Q9NQ66 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLCB1Q9NQ66 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLCB1Q9NQ66 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLCB1Q9NQ66 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLCB1Q9NQ66 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PLCB1Q9NQ66 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PLCB1Q9NQ66 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLCB1Q9NQ66 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLCB1Q9NQ66 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLCB1Q9NQ66 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLCB1Q9NQ66 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLCB1Q9NQ66 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLCB1Q9NQ66 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLCB1Q9NQ66 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLCB1Q9NQ66 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PLCB1Q9NQ66 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PLCB1Q9NQ66 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLCB1Q9NQ66 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLCB1Q9NQ66 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLCB1Q9NQ66 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PLCB1Q9NQ66 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLCB1Q9NQ66 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLCB1Q9NQ66 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PLCB1Q9NQ66 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLCB1Q9NQ66 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PLCB1Q9NQ66 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLCB1Q9NQ66 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLCB1Q9NQ66 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLCB1Q9NQ66 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLCB1Q9NQ66 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLCB1Q9NQ66 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLCB1Q9NQ66 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PLCB1Q9NQ66 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLCB1Q9NQ66 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLCB1Q9NQ66 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PLCB1Q9NQ66 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLCB1Q9NQ66 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLCB1Q9NQ66 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLCB1Q9NQ66 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLCB1Q9NQ66 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLCB1Q9NQ66 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PLCB1Q9NQ66 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PLCB1Q9NQ66 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PLCB1Q9NQ66 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PLCB1Q9NQ66 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLCB1Q9NQ66 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLCB1Q9NQ66 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLCB1Q9NQ66 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLCB1Q9NQ66 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLCB1Q9NQ66 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLCB1Q9NQ66 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLCB1Q9NQ66 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLCB1Q9NQ66 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLCB1Q9NQ66 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLCB1Q9NQ66 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLCB1Q9NQ66 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLCB1Q9NQ66 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLCB1Q9NQ66 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLCB1Q9NQ66 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLCB1Q9NQ66 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLCB1Q9NQ66 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PLCB1Q9NQ66 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLCB1Q9NQ66 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLCB1Q9NQ66 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLCB1Q9NQ66 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLCB1Q9NQ66 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PLCB1Q9NQ66 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLCB1Q9NQ66 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLCB1Q9NQ66 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
PLCB1Q9NQ66 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PLCB1Q9NQ66 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PLCB1Q9NQ66 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PLCB1Q9NQ66 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PLCB1Q9NQ66 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PLCB1Q9NQ66 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PLCB1Q9NQ66 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PLCB1Q9NQ66 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PLCB1Q9NQ66 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
PLCB1Q9NQ66 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PLCB1Q9NQ66 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLCB1Q9NQ66 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PLCB1Q9NQ66 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PLCB1Q9NQ66 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLCB1Q9NQ66 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms