Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI0

TMEM138, Transmembrane protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM138Q9NPI0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM138Q9NPI0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM138Q9NPI0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM138Q9NPI0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM138Q9NPI0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM138Q9NPI0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM138Q9NPI0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM138Q9NPI0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM138Q9NPI0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM138Q9NPI0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM138Q9NPI0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM138Q9NPI0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM138Q9NPI0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM138Q9NPI0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM138Q9NPI0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM138Q9NPI0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM138Q9NPI0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM138Q9NPI0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM138Q9NPI0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM138Q9NPI0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms