Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMG20AQ9NP66 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMG20AQ9NP66 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20AQ9NP66 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20AQ9NP66 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20AQ9NP66 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20AQ9NP66 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20AQ9NP66 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMG20AQ9NP66 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HMG20AQ9NP66 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HMG20AQ9NP66 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMG20AQ9NP66 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20AQ9NP66 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMG20AQ9NP66 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMG20AQ9NP66 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMG20AQ9NP66 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMG20AQ9NP66 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMG20AQ9NP66 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMG20AQ9NP66 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMG20AQ9NP66 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMG20AQ9NP66 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMG20AQ9NP66 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMG20AQ9NP66 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMG20AQ9NP66 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMG20AQ9NP66 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMG20AQ9NP66 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMG20AQ9NP66 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20AQ9NP66 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20AQ9NP66 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20AQ9NP66 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20AQ9NP66 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20AQ9NP66 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20AQ9NP66 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMG20AQ9NP66 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMG20AQ9NP66 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20AQ9NP66 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20AQ9NP66 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMG20AQ9NP66 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20AQ9NP66 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20AQ9NP66 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20AQ9NP66 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMG20AQ9NP66 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMG20AQ9NP66 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMG20AQ9NP66 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMG20AQ9NP66 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMG20AQ9NP66 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMG20AQ9NP66 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMG20AQ9NP66 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMG20AQ9NP66 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms