Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DNAJC4Q9NNZ3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DNAJC4Q9NNZ3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
DNAJC4Q9NNZ3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
DNAJC4Q9NNZ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DNAJC4Q9NNZ3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
DNAJC4Q9NNZ3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
DNAJC4Q9NNZ3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DNAJC4Q9NNZ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DNAJC4Q9NNZ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
DNAJC4Q9NNZ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DNAJC4Q9NNZ3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DNAJC4Q9NNZ3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
DNAJC4Q9NNZ3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms