Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PREBQ9HCU5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PREBQ9HCU5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PREBQ9HCU5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PREBQ9HCU5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PREBQ9HCU5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PREBQ9HCU5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PREBQ9HCU5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PREBQ9HCU5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PREBQ9HCU5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PREBQ9HCU5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PREBQ9HCU5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PREBQ9HCU5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PREBQ9HCU5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PREBQ9HCU5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PREBQ9HCU5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PREBQ9HCU5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PREBQ9HCU5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PREBQ9HCU5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PREBQ9HCU5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PREBQ9HCU5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PREBQ9HCU5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PREBQ9HCU5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PREBQ9HCU5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PREBQ9HCU5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PREBQ9HCU5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PREBQ9HCU5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PREBQ9HCU5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PREBQ9HCU5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PREBQ9HCU5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PREBQ9HCU5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PREBQ9HCU5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PREBQ9HCU5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PREBQ9HCU5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PREBQ9HCU5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PREBQ9HCU5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PREBQ9HCU5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PREBQ9HCU5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PREBQ9HCU5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PREBQ9HCU5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PREBQ9HCU5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PREBQ9HCU5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PREBQ9HCU5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PREBQ9HCU5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PREBQ9HCU5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PREBQ9HCU5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PREBQ9HCU5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PREBQ9HCU5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PREBQ9HCU5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PREBQ9HCU5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PREBQ9HCU5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PREBQ9HCU5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PREBQ9HCU5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PREBQ9HCU5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PREBQ9HCU5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PREBQ9HCU5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PREBQ9HCU5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PREBQ9HCU5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PREBQ9HCU5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PREBQ9HCU5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PREBQ9HCU5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PREBQ9HCU5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PREBQ9HCU5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PREBQ9HCU5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PREBQ9HCU5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PREBQ9HCU5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PREBQ9HCU5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PREBQ9HCU5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 265.4 ms