Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CENPJQ9HC77 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CENPJQ9HC77 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CENPJQ9HC77 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CENPJQ9HC77 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CENPJQ9HC77 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CENPJQ9HC77 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CENPJQ9HC77 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CENPJQ9HC77 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CENPJQ9HC77 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CENPJQ9HC77 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CENPJQ9HC77 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CENPJQ9HC77 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CENPJQ9HC77 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
CENPJQ9HC77 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CENPJQ9HC77 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CENPJQ9HC77 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
CENPJQ9HC77 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CENPJQ9HC77 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CENPJQ9HC77 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CENPJQ9HC77 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CENPJQ9HC77 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CENPJQ9HC77 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CENPJQ9HC77 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CENPJQ9HC77 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CENPJQ9HC77 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CENPJQ9HC77 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CENPJQ9HC77 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CENPJQ9HC77 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CENPJQ9HC77 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CENPJQ9HC77 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CENPJQ9HC77 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CENPJQ9HC77 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CENPJQ9HC77 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CENPJQ9HC77 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CENPJQ9HC77 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CENPJQ9HC77 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CENPJQ9HC77 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CENPJQ9HC77 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CENPJQ9HC77 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CENPJQ9HC77 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CENPJQ9HC77 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CENPJQ9HC77 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CENPJQ9HC77 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CENPJQ9HC77 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CENPJQ9HC77 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CENPJQ9HC77 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CENPJQ9HC77 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CENPJQ9HC77 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
CENPJQ9HC77 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CENPJQ9HC77 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CENPJQ9HC77 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CENPJQ9HC77 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CENPJQ9HC77 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CENPJQ9HC77 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CENPJQ9HC77 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CENPJQ9HC77 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CENPJQ9HC77 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CENPJQ9HC77 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CENPJQ9HC77 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CENPJQ9HC77 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CENPJQ9HC77 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CENPJQ9HC77 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CENPJQ9HC77 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CENPJQ9HC77 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CENPJQ9HC77 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CENPJQ9HC77 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CENPJQ9HC77 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CENPJQ9HC77 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CENPJQ9HC77 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CENPJQ9HC77 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CENPJQ9HC77 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CENPJQ9HC77 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CENPJQ9HC77 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
CENPJQ9HC77 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CENPJQ9HC77 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CENPJQ9HC77 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CENPJQ9HC77 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CENPJQ9HC77 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CENPJQ9HC77 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CENPJQ9HC77 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CENPJQ9HC77 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CENPJQ9HC77 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CENPJQ9HC77 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CENPJQ9HC77 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CENPJQ9HC77 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CENPJQ9HC77 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CENPJQ9HC77 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CENPJQ9HC77 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CENPJQ9HC77 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CENPJQ9HC77 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CENPJQ9HC77 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CENPJQ9HC77 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CENPJQ9HC77 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CENPJQ9HC77 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CENPJQ9HC77 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CENPJQ9HC77 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CENPJQ9HC77 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CENPJQ9HC77 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms