Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM27Q9HBJ8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM27Q9HBJ8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM27Q9HBJ8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM27Q9HBJ8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM27Q9HBJ8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM27Q9HBJ8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM27Q9HBJ8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM27Q9HBJ8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM27Q9HBJ8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM27Q9HBJ8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM27Q9HBJ8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM27Q9HBJ8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM27Q9HBJ8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM27Q9HBJ8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM27Q9HBJ8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM27Q9HBJ8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM27Q9HBJ8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM27Q9HBJ8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM27Q9HBJ8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM27Q9HBJ8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM27Q9HBJ8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM27Q9HBJ8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM27Q9HBJ8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM27Q9HBJ8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM27Q9HBJ8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM27Q9HBJ8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM27Q9HBJ8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM27Q9HBJ8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM27Q9HBJ8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM27Q9HBJ8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM27Q9HBJ8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM27Q9HBJ8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM27Q9HBJ8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM27Q9HBJ8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM27Q9HBJ8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM27Q9HBJ8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM27Q9HBJ8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM27Q9HBJ8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM27Q9HBJ8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM27Q9HBJ8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM27Q9HBJ8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM27Q9HBJ8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM27Q9HBJ8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM27Q9HBJ8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM27Q9HBJ8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM27Q9HBJ8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM27Q9HBJ8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM27Q9HBJ8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM27Q9HBJ8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM27Q9HBJ8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms