Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1Z8

C2orf40, Augurin, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf40Q9H1Z8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
C2orf40Q9H1Z8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C2orf40Q9H1Z8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C2orf40Q9H1Z8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
C2orf40Q9H1Z8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C2orf40Q9H1Z8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C2orf40Q9H1Z8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
C2orf40Q9H1Z8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C2orf40Q9H1Z8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C2orf40Q9H1Z8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C2orf40Q9H1Z8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C2orf40Q9H1Z8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C2orf40Q9H1Z8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C2orf40Q9H1Z8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
C2orf40Q9H1Z8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
C2orf40Q9H1Z8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C2orf40Q9H1Z8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C2orf40Q9H1Z8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C2orf40Q9H1Z8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C2orf40Q9H1Z8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C2orf40Q9H1Z8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C2orf40Q9H1Z8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C2orf40Q9H1Z8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C2orf40Q9H1Z8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C2orf40Q9H1Z8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C2orf40Q9H1Z8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C2orf40Q9H1Z8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C2orf40Q9H1Z8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C2orf40Q9H1Z8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C2orf40Q9H1Z8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C2orf40Q9H1Z8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
C2orf40Q9H1Z8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C2orf40Q9H1Z8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C2orf40Q9H1Z8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C2orf40Q9H1Z8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C2orf40Q9H1Z8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C2orf40Q9H1Z8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C2orf40Q9H1Z8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C2orf40Q9H1Z8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C2orf40Q9H1Z8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C2orf40Q9H1Z8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
C2orf40Q9H1Z8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C2orf40Q9H1Z8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C2orf40Q9H1Z8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C2orf40Q9H1Z8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
C2orf40Q9H1Z8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
C2orf40Q9H1Z8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C2orf40Q9H1Z8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C2orf40Q9H1Z8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
C2orf40Q9H1Z8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C2orf40Q9H1Z8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C2orf40Q9H1Z8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C2orf40Q9H1Z8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C2orf40Q9H1Z8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C2orf40Q9H1Z8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
C2orf40Q9H1Z8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C2orf40Q9H1Z8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
C2orf40Q9H1Z8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C2orf40Q9H1Z8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C2orf40Q9H1Z8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
C2orf40Q9H1Z8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C2orf40Q9H1Z8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C2orf40Q9H1Z8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C2orf40Q9H1Z8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C2orf40Q9H1Z8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C2orf40Q9H1Z8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C2orf40Q9H1Z8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
C2orf40Q9H1Z8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
C2orf40Q9H1Z8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C2orf40Q9H1Z8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C2orf40Q9H1Z8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C2orf40Q9H1Z8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C2orf40Q9H1Z8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C2orf40Q9H1Z8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms